Rosetta@home - проект добровольных вычислений белка на домашних ПК

«Не нужно быть ученым, чтобы делать науку»
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/

Rosetta@Home — проект добровольных вычислений, направленный на решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии — вычисление третичной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря завершённому проекту «Геном человека» известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, несуществующих белков. Хотя большая часть проекта ориентируется на фундаментальные исследования в области улучшения точности и надежности методов протеомики, Rosetta@home также способствует прикладным исследованиям для борьбы с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями.

Результаты вычислений Rosetta@Home не доступны напрямую. Так же, нельзя использовать результаты вычислений собственного компьютера. Однако они используются для большого количества научных публикаций.

По сути Rosetta — это компьютерная программа, основными задачами которой являются:

поиск структуры с наименьшей энергией для заданной аминокислотной последовательности для предсказания структуры белка;
решение обратной задачи — поиск аминокислотной последовательности с наименьшей энергией для заданной белковой структуры;
расчёт взаимодействия комплекса белок-белок.

В данном проекте используется обратная связь по прогнозированию и полученным результатам, чтобы улучшать потенциальные функции и алгоритмы поиска.

О проекте поближе

Главная страница проекта встречает нас подробной информацией.

Причем главный является именно этот блок. Rosetta@home — не приносит прибыль.

Тут же справа встречаем новость про то, что набор молекулярного моделирования Rosetta был недавно использован для точного предсказания атомно-масштабной структуры важного белка коронавируса за несколько недель до того, как его можно было измерить в лаборатории. Знания, полученные в результате изучения этого вирусного белка, в настоящее время используются для разработки новых вакцин и противовирусных препаратов.

Еще ниже можно посмотреть статистику задач за последние 24 часа. Сколько задач всего, сколько в процессе вычислений, сколько сделано.

На сайте также можно найти описания и конфигурацию серверов проекта.

Если посмотреть полную статистику проекта, то можно увидеть количество участников и компьютеров. А также количество ГигаФЛОПС — 218243.93 — это 218,24393 ТераФЛОПС. Для сравнения, графический процессор Playstation 4 состоит из 18 вычислительных блоков, позволяющих достичь теоретической максимальной производительности 1,84 TераФЛОПС.